Y la cereza en el pastel de su trayectoria, fue electo presidente del PRI para el periodo 2015–2019, sin embargo, como consecuencia de la derrota que sufrió el partido en las elecciones de 12 estados de la República, Manlio presentó su renuncia el día 20 de junio del 2016 a la dirigencia del PRI. Hoy nuevamente aparece en la palestra, gracias al video donde Bermúdez Zurita lo pone como principal receptor de 500 millones de parte del preso del penal de Matamoros, Guatemala.
En verdad no nos sorprende esta noticia, es bien sabido que dicho personaje ha sabido nadar en el oleaje político y siempre relacionado con buenas cantidades de dinero. Tenga la certeza que para este político sólo será una raya más a su pelaje, no pasará absolutamente nada, ya que el sonorense forma parte de la privilegiada élite política mexicana. Es más, quiere ser presidente.