Otro de los protegidos de Alejandro Gertz Manero se llama Emilio Lozoya, a quien le había concedido arresto domiciliario, hasta que el exdirector de Pemex fue descubierto comiendo pato pekinés en un restaurante de lujo. Una vez que salió Alejandro Gertz Manero, se encendió la alerta para todos los protegidos del exfiscal Gertz Manero. César Duarte no pudo huir a tiempo y a Emilio Lozoya le fue negado un amparo por el caso de Agronitrogenados. La defensa de Lozoya argumenta que si Alonso Ancira, quien vendió la pĺanta chatarra de agronitrogenados a Pemex, decidió devolver el dinero que le dieron, eso beneficiaba a Lozoya, acusado por la compra fraudulenta de esa planta.
El magistrado instructor, Ezequiel Altamirano Roches, integrante del Segundo Tribunal Colegiado de Apelación en Materia Penal del Primer Circuito señaló que no se puede aceptar que, si un coimputado se haga cargo de la reparación del daño que a él confiere, eso pueda beneficiar a los otros coimputados.
Es decir, en este caso cada quien pagará por sus platos rotos. Además, de los 216 millones de dólares que Ancira se comprometió a pagar, sólo se han pagado 110 millones de dólares, quedando pendientes 106 millones de dólares. Lozoya ya dormía tranquilo en su casita, sin embargo, al parecer el gobierno de la 4T piensa pedirle más dinero para que siga gozando de su libertad a medias.